旋轉編碼器屬精密元件，這主要因為旋轉編碼器周圍干擾比較嚴重，比如：是否有大型電動機、電焊機頻繁起動造成干擾，是否和動力線同一管道傳輸等。
選擇什么樣的輸出對抗干擾也很重要，一般輸出帶反向信號的抗干擾要好一些，即A+~A-,B+~B-,Z+~Z-，其特征是加上電源8 根線，而不是5 根線(共零)。帶反向信號的在電纜中的傳輸是對稱的，受干擾小，在接受設備中也可以再增加判斷（例如接受設備的信號利用A、B 信號90°相位差，讀到電平10、11、01、00 四種狀態時，計為一有效脈沖，此方案可有效提高系統抗干擾性能（計數準確））。就是旋轉編碼器也有好壞，其碼盤\電子芯片\內部電路\信號輸出的差別很大，要不然怎么一個1000 線的增量型編碼器會從300 多元到3000 多元差別那么大呢?
①排除(搬離、關閉、隔離)干擾源
②判斷是否為機械間隙累計誤差
③判斷是否為控制系統和編碼器的電路接口不匹配（編碼器選型錯誤）
①②③方法償試后故障現象排除，則可初步判斷，若未排除須進一步分析。
判斷是否為旋轉編碼器自身故障的簡單方法是排除法。
廣東升威電子制品有限公司專業生產旋轉編碼器25年,已大規模生產，技術生產已成熟運用，產品故障率控制在千分之幾。
排除法的具體方法是：用一臺相同型號的旋轉編碼器替換上去，如果故障現象相同，可基本排除是旋轉編碼器故障問題，因為兩臺旋轉編碼器同時有故障的小概率事件發生可能很小，可以看作為0。假如換一臺相同型號旋轉編碼器上去，故障現象立刻排除，則可基本判定是旋轉編碼器故障。